Ο Hideo Kojima επιβεβαίωσε ότι το Zone of Enders θα αποκτήσει ένα ακόμα sequel κάποια στιγμή στο μέλλον. Μάλιστα, ο γνωστός δημιουργός αποκάλυψε ότι κατηγορεί τον εαυτό του για τις φτωχές πωλήσεις του ZOE 2. "Αν δεν είχα κάνει λάθος όσον αφορά την ημερομηνία κυκλοφορίας, το Zone of Enders 2 θα μπορούσε να αποτελέσει ένα "μεγάλο" τίτλο για την Kojima Productions, έναν τίτλο που θα ακολουθούσε το MGS". ανέφερε ο θρυλικός δημιουργός και πρόσθεσε "Θα θέλαμε να δημιουργήσουμε ένα sequel του ZOE 2 κάποια στιγμή. Και αισθανόμαστε ότι, αν το κάνουμε, θα μας άρεσε να κάνουμε το franchise του Zone of Enders επιτυχημένο αυτή τη φορά. Έχω ήδη πλάνα για το παιχνίδι και σχέδια που αφορούν τον τομέα των πωλήσεων. Όμως δεν γνωρίζω αν θα πάρουμε το πράσινο φως. Οι γραμμές παραγωγής της Kojima Productions είναι ήδη γεμάτες. Δε μπορώ να υποσχεθώ κάτι σχετικά με το πότε. Μπορώ όμως να υποσχεθώ ένα sequel".