Η Bungie κατοχύρωσε ξανά την επωνυμία "Marathon", κάτι το οποίο μπορεί να κρύβει την επανεμφάνιση της σειράς στην τρέχουσα γενιά συστημάτων. Το πρωτότυπο Marathon κυκλοφόρησε το 1994, ήταν δημιουργημένο από τη Bungie και κυκλοφόρησε αποκλειστικά σε Apple Mac. Τα γεγονότα του παιχνιδιού διεξάγονται το έτος 2794 επάνω σε ένα τεράστιο διαστημόπλοιο με το όνομα UESC (United Earth Space Council) Marathon.

Ακολούθησαν δύο sequels, το Marathon 2: Durandal το 1995 και το Marathon Infinity το 1996.